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From Pitagora-Galaxy Wiki
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手順書

現在の手順書

名称 概要
構築手順_0.2.x 過去の Pitagora Galaxy の構築手順
構築手順_0.3.x 現在の Pitagora Galaxy の構築手順
構築手順_0.4.x 次期の Pitagora Galaxy の構築手順
VM配布準備手順
データ移行手順 新しいバージョンの Pitagora-Galaxy にデータを移行する手順
テスト手順 既存のワークフローの動作確認の手順
AMI公開手順 VM を AMI に変換する手順
テストサイト設定手順 テストサイトを AMI から作成する手順
ツールの開発 Galaxy ツール、Tool Shed レポジトリ、Tool Dependency Package の作り方
ツールのバージョン管理 Galaxy ツールのバージョンと Tool Shed のリポジトリの関係、これらの管理
ツールのコンテナ化 Galaxy ツールを Docker コンテナにする方法
VMWare で起動する手順 Pitagora 0.1.6 を VMWare Fusion で起動する際の手順
KVM で起動する手順
リファレンスの追加手順 リファレンス・ゲノムやツールのインデックスの追加手順
その他

以前の手順書

名称 概要
構築手順_0.1.x バージョン 0.1.x のときの構築手順
ツールインストール手順 0.1.x の手順。0.2.x では代わりに Tool Shed から API でインストールしている。
Galaxyのインストール 一般的な Galaxy のインストール手順
Galaxyの高度な設定 一般的な Galaxy のインストール手順(続き)
ツールのインストール 一般的なツールのインストール方法

各ワークフローの管理用ページ

その他

名称 概要
ToolShedについて ToolShedの動作仕様について(Revisionの管理方法など)
プレゼンテーション 学会発表など
Implementing Reproducible .. Implementing Reproducible Research のレビュー
Welcome テストサイトの Welcome ページ
Wikiの作成手順 このWikiの作成手順
GWT2016 Plan Galaxy Workshop 2016 の企画用ページ
DDBJ Galaxy DDBJ Galaxy 関連の情報