Tool cuffdiff

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概要

  • Cufflinksのコマンドの1つです。異なる2群間の発現量やスプライスパターンの差異を検出します。

入力ファイル

  • 2群間のマップ済みのリード(bam), Cuffmergeでマージされたトランスクリプト(gtf)

出力ファイル

  • 発現量の統計情報(tsv)