Tool cufflinks

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概要

  • 異なるスプライシングバリアント毎の発現量の算出や新規転写産物のアセンブルを行います。

入力ファイル

  • TopHatのマップ済みリード(bam)

出力ファイル

  • FPKM(txt, tsv )
  • トランスクリプション(gtf)